62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3474 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  263  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  54.78 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  46.03 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  50 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  47.54 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  48.39 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  49.18 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  48.39 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  48.72 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  49.6 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  49.14 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  49.18 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  50.41 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  47.93 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  51.64 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  47.86 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  47.58 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  45.97 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  43.55 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  46.4 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  44.53 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  44.72 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  47.15 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  45.08 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  43.33 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  47.06 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  44 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  40.65 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  40.34 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.52 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  34.4 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.29 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  37.6 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.73 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  36.08 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.91 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  64.52 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  64.52 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  64.52 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 272 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.26 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  48.78 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.18 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.25 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.18 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  46.34 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  46.34 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.03 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  62.96 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.23 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.18 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 197 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  33.05 
 
 		 131 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  33.05 
 
 		 131 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  33.63 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  45 
 
 		 47 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>