146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1789 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 198 aa  411  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  47.94 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  33.09 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 277 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  28.93 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  31.62 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  29.11 
 
 		 374 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  29.11 
 
 		 374 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 127 aa  51.2  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  29.11 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  27.82 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  29.11 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 374 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  30.38 
 
 		 436 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  30.25 
 
 		 125 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  28.07 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  47.5 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 327 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 368 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 361 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 328 aa  48.5  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  28.07 
 
 		 124 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  27.97 
 
 		 126 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 370 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  25 
 
 		 126 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.21 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 95 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  26.23 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  27.59 
 
 		 126 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  24.03 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  31.75 
 
 		 459 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 322 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  51.22 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  33.87 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 474 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  28.57 
 
 		 293 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  25.44 
 
 		 126 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 364 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 139 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 115 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 380 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 123 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  30.17 
 
 		 126 aa  45.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 369 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 62 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.75 
 
 		 508 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.91 
 
 		 126 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  34.38 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 115 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  39.62 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  28.93 
 
 		 126 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  27.73 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  41.27 
 
 		 652 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.1 
 
 		 128 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  26.72 
 
 		 125 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>