More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0239 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  226  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  77.68 
 
 
118 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  69.64 
 
 
123 aa  156  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  45.16 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  29.82 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  29.82 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.9 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  44.07 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.9 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.9 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  34.55 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  43.06 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  46.55 
 
 
459 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.32 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 
196 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
374 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
205 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 
355 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  35.44 
 
 
301 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.49 
 
 
194 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
208 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.38 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  34.38 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  43.33 
 
 
436 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
364 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.03 
 
 
296 aa  56.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  40.68 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  27.19 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  43.55 
 
 
348 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  44.07 
 
 
328 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
206 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
204 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
268 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
231 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 
338 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
273 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  35.48 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  39.44 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 
380 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  40.68 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
395 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
334 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  33.87 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  31.3 
 
 
347 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
262 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 
262 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  39.34 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  42.37 
 
 
68 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 
262 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  38.1 
 
 
259 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 
262 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 
380 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  39.34 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  39.34 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  30.1 
 
 
374 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
224 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 
368 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
128 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
261 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
371 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>