115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3849 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 87 aa  184  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 281 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 279 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  32.84 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 395 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.1 
 
 		 436 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 261 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  30.65 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.25 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 394 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  29.03 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 312 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  33.33 
 
 		 347 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1991  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 84 aa  43.5  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  30.16 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  27.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  33.9 
 
 		 652 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0142  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0927186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  30.16 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  30.16 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 369 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 380 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  29.51 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  30.16 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  30.16 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  30.65 
 
 		 149 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  28.79 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 320 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 370 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 355 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  26.56 
 
 		 459 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>