172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1926 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1991  Cro/CI family transcriptional regulator  74.23 
 
 		 204 aa  149  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 368 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 374 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 374 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 		 369 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 374 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  38.57 
 
 		 374 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 374 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 374 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 374 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 374 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 321 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  40 
 
 		 374 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 244 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 370 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  32.47 
 
 		 338 aa  48.5  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 91 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 261 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 114 aa  48.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 73 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.1 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  26.5 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.71 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 362 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0763  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 109 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.042345  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 312 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.92 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  29.63 
 
 		 233 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  36.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 111 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30.56 
 
 		 114 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 97 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  30.56 
 
 		 114 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 		 125 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  33.02 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 82 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 320 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 372 aa  44.7  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  31.78 
 
 		 114 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  33.68 
 
 		 101 aa  44.7  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 80 aa  44.7  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 104 aa  44.3  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 247 aa  44.3  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 432 aa  44.3  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 		 459 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  28.33 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  27.94 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  29.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  31.67 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2282  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>