More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0697 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.24 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.24 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.24 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  42.62 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  35.35 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.95 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  34.4 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 433 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  33.63 
 
 		 248 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  30.56 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 349 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  51.11 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 259 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 327 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0020  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  39.47 
 
 		 210 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  36.99 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2958  transcriptional regulator HTH family  38.37 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.62 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 262 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  32 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  36.49 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 262 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  32 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  33.71 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 123 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 301 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.37 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>