89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0599 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  39.06 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.81 
 
 		 301 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.29 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 274 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  38 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  44.9 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  44.9 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  34.43 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.87 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  31.25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  30.43 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  32.2 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.87 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 123 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 		 121 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 149 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 108 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 104 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  26.15 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1148  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 127 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>