130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0218 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  310  4.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.44 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  45.61 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  34.17 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  33.06 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 123 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  40 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.9 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  40 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 124 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.38 
 
 		 436 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  36.21 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0914  helix-turn-helix domain protein  35.09 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0680459  hitchhiker  0.00000175026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.9 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1997  helix-turn-helix domain protein  34.48 
 
 		 107 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  hitchhiker  0.000964376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  45.16 
 
 		 301 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 74 aa  44.3  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 67 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5549  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361846  hitchhiker  0.00439273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 67 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40.35 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.82 
 
 		 113 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.82 
 
 		 113 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  29.35 
 
 		 211 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  32.91 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  32.91 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 145 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 374 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.35 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  33.78 
 
 		 116 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 281 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>