157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2814 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  76.19 
 
 		 135 aa  202  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 505 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 268 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 395 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  34.74 
 
 		 303 aa  50.8  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  39.71 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  40.91 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  36.62 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0355  hypothetical protein  27.91 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  33.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 312 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.72 
 
 		 338 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  28.28 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  35.94 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  32.39 
 
 		 293 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  31.75 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  32 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.1 
 
 		 436 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  31.67 
 
 		 342 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  27 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  29.03 
 
 		 262 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  28.26 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.07 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  28.26 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.07 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  29.03 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 262 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  25.27 
 
 		 459 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  33.33 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 374 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5909  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.07 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>