89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0622 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0254  transcriptional regulator, putative  83.92 
 
 
215 aa  338  9e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  46.89 
 
 
303 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  43.33 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  44.22 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  46.2 
 
 
312 aa  192  9e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0564  hypothetical protein  77.19 
 
 
111 aa  163  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  27.54 
 
 
215 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7198  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
134 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0637638 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6040  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
134 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 
145 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
113 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2727  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
133 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 
123 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
133 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 
123 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
83 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4093  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 
121 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 
128 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4413  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
121 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465238  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9533  transcriptional regulator Cro/CI family  35 
 
 
141 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 
175 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3790  XRE family transcriptional regulator  24.41 
 
 
129 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6164  hypothetical protein  30.43 
 
 
132 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
120 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
120 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
149 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
120 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  33.78 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
171 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  25.5 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
130 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 
161 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  58.97 
 
 
303 aa  47  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  57.5 
 
 
298 aa  47  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
189 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
201 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  40 
 
 
144 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
142 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  38.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
119 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
118 aa  45.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
114 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3038  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
137 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
67 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6062  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
138 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
191 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
68 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  28.77 
 
 
131 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
111 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6073  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 
110 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 
134 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
140 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3622  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
140 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 
174 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2278  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
136 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504941  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6881  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
143 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 
126 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  26.04 
 
 
140 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
163 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
407 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  30.56 
 
 
209 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  30.93 
 
 
489 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
135 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
407 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3775  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 
210 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  35.21 
 
 
73 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
390 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>