168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1529 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 139 aa  273  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  50.71 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  47.79 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 505 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 490 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0194  hypothetical protein  33.63 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  39.6 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.33 
 
 		 481 aa  48.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 497 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 489 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  37.31 
 
 		 308 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 256 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  41.54 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  30.86 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  31.54 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3680  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 490 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 321 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 528 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  40.28 
 
 		 489 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  32.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  32.26 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.57 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 478 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  38.6 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  38.6 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 488 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  32.03 
 
 		 270 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  36.49 
 
 		 476 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  36.71 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.9 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.9 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0337  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160189  normal  0.0633386 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  47.37 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  34.43 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  42 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40 
 
 		 508 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  33.8 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35.59 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  43.86 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  32.26 
 
 		 209 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  29.07 
 
 		 222 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 133 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 119 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  33.33 
 
 		 205 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 104 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  39.47 
 
 		 513 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 68 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>