57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5660 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 490 aa  987    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 497 aa  792    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4024  transcriptional regulator, XRE family  51.65 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0917395  hitchhiker  0.00196902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5646  putative HTH-type transcriptional regulator  43.92 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3817  hypothetical protein  41.64 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  46.51 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1987  helix-turn-helix domain-containing protein  40.24 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00401079  normal  0.325189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3639  hypothetical protein  28.95 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 80 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 80 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 80 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 80 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 80 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 127 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 80 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 113 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 110 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.94 
 
 		 508 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 81 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 191 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  33.78 
 
 		 117 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 114 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 139 aa  47  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 77 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 78 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 163 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  29.82 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 104 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.94 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 191 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 113 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  36.54 
 
 		 75 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 77 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 91 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 128 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 83 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 145 aa  43.5  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 99 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 76 aa  43.5  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 85 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  43.5  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 78 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>