83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0873 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  81.78 
 
 		 214 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  29.44 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  29.44 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  29.44 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  25.84 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 79 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 101 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 85 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 90 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 90 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 78 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  22.4 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 145 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 130 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.16 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  31.73 
 
 		 312 aa  46.2  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  30 
 
 		 114 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  30 
 
 		 114 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 81 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  35.94 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3737  putative transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 95 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.212597  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 70 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 94 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.48 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.82 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 101 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 		 77 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8538  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000674281  hitchhiker  0.0000867328 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  25.63 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 490 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 75 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 403 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  30.67 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 176 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  38.46 
 
 		 226 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 75 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  22.03 
 
 		 200 aa  42  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 371 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 72 aa  42  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.07 
 
 		 509 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  30.09 
 
 		 294 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 69 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>