31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3737 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3737  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.212597  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 230 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  33.8 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.59 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  34.29 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 97 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 80 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 83 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 490 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3098  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  36.07 
 
 		 154 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>