More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1231 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  137  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 404 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 403 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 403 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 403 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 403 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 403 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  38.33 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 404 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  39.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 432 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  43.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 176 aa  48.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 371 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  38.6 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 488 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 198 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  37.88 
 
 		 245 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 403 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 403 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  30.88 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  40 
 
 		 404 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 252 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 383 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  32.79 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>