More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4019 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  88.41 
 
 		 72 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6741  putative transcriptional regulator  59.62 
 
 		 58 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0202746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 505 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  35.38 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.68 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  46.67 
 
 		 652 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 57 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  40 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04285  DNA-binding protein, putative  44.44 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 642 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  40 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  35 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  36.51 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>