231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1485 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 75 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  43.28 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  40.3 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0127  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.797375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  38.03 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  38.46 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  40.54 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 390 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9804  helix turn helix transcriptional regulator  36.92 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  36.51 
 
 		 467 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  41.38 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.03 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.21 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  36.92 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  30.14 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  37.5 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2870  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>