161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1799 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 78 aa  157  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  37.68 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  40 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.81 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  39.06 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  32.88 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  32.1 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 390 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  34.48 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  38.57 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 245 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>