More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0675 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1275 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.59 
 
 		 1665 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.86 
 
 		 75 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 77 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  45.16 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  45.16 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  46.88 
 
 		 67 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 814 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 90 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 81 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 76 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  38.57 
 
 		 72 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 83 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  41.89 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 76 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 73 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 91 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 81 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 76 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 69 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 73 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1419 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 69 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 995 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 69 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 100 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 73 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 78 aa  53.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 80 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 69 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 83 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  37.5 
 
 		 154 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 931 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 106 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 68 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  43.84 
 
 		 93 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 66 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 90 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 70 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 79 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  43.86 
 
 		 68 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 77 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  36.92 
 
 		 69 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 83 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 75 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 71 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 101 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  39.51 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 72 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 333 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 71 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 78 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 80 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 88 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  43.75 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 90 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  32.94 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.46 
 
 		 81 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 97 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 76 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 76 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  38.36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  38.36 
 
 		 84 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 71 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>