77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0190 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2292  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  30.88 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  47.73 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  39.13 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 737 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 177 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  36.84 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 99 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 171 aa  40.8  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5088  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  40  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 207 aa  40  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 93 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 77 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  26.56 
 
 		 204 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 218 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 76 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>