156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0890 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  45.28 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 255 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 256 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  39.13 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  39.13 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  39.13 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 213 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  39.39 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  39.39 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  39.39 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  39.39 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 371 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.92 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  39.34 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 109 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 147 aa  43.5  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 190 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.92 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0167  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  37.14 
 
 		 652 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.92 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  36.92 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>