267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1184 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 212 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  46.67 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.09 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 528 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  33.85 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.44 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 516 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  35 
 
 		 403 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2413  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  35 
 
 		 403 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 371 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  43.33 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 432 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.43 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  32.31 
 
 		 200 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.43 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  34.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 253 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>