208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2371 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 165 aa  331  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  50 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 528 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 281 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 128 aa  50.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 346 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  46.3 
 
 		 114 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  46.3 
 
 		 114 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 432 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  39.73 
 
 		 488 aa  48.5  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 195 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 300 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 277 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40.54 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  37.29 
 
 		 114 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  36.25 
 
 		 308 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  46.3 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 436 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  44.83 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 256 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  36.67 
 
 		 476 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  33.96 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.09 
 
 		 114 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 488 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35.09 
 
 		 114 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  32 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 490 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  36.54 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 490 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 75 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 75 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 75 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 255 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  36.71 
 
 		 302 aa  44.3  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  35.48 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  28.36 
 
 		 327 aa  44.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 112 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 72 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 199 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.59 
 
 		 199 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  38.46 
 
 		 430 aa  44.3  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 403 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  43.64 
 
 		 475 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  37.29 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 334 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 404 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  35.48 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>