184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12052 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  35.6 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  33.93 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  34.84 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  31.98 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  31.17 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.13 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  30.2 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  34.55 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  30.98 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 367 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  32.41 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  30.64 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  28.3 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  26.59 
 
 		 399 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  33 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  28.76 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.2 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  27.85 
 
 		 376 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  29.97 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  31.72 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  30.36 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.88 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  32.59 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  30.1 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  34.15 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  27.7 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  26.96 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  26.73 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  26.73 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.85 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  26.54 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  28.85 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.48 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.36 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.55 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  22.19 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  26.42 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  30.33 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  31.3 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  26.88 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  31.25 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  30.32 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  26.6 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  27.89 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  25.44 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  28.92 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  33.86 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  26.14 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  35.19 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  41.67 
 
 		 147 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  38.55 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  26.19 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.65 
 
 		 188 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 163 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  24.52 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  28.91 
 
 		 283 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  25.61 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  34.34 
 
 		 270 aa  52.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 163 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  28.35 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  43.75 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 165 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 152 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.76 
 
 		 156 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 422 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  40 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 142 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  29.73 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  38.2 
 
 		 196 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 89 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 68 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 141 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 117 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 169 aa  46.6  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 99 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  38.37 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  22.91 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 145 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  25.78 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>