99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0062 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  50.83 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  47.28 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  41.92 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  39.43 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  34.37 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  30.87 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  35.33 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  31.06 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  31.38 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  29.68 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  28.01 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  28.49 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  29.68 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  30.36 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  30.23 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  29.15 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  26.94 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  31.79 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.03 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.63 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  27.5 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.61 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.81 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  31.08 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  30.59 
 
 		 359 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  27.96 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  30.82 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.9 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  27.73 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  23.82 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  23.82 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.26 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  29.69 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  28.66 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  28.66 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  28.66 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  24.1 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  48.48 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  28.7 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  27.76 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.61 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  27.89 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  22.28 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  33.05 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  28.25 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  28.63 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  35.16 
 
 		 169 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  25.17 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  37.08 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 163 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  22.67 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  24.85 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  24.76 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  31.88 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  31.88 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  35.59 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  24.55 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.42 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  22.84 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  29.56 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.74 
 
 		 174 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  33.67 
 
 		 307 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 111 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30.21 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  32.2 
 
 		 233 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.86 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  26.19 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.2 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  36.23 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  25.69 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  38.33 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  32.58 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  34.57 
 
 		 147 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  25.3 
 
 		 173 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 109 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.78 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  31.19 
 
 		 181 aa  43.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  35.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 110 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  30.49 
 
 		 179 aa  42.7  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 104 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>