52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5397 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  834    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  76.03 
 
 
416 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  29.62 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  27.25 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  28.86 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.74 
 
 
401 aa  89.7  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  25.54 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  28.31 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  27.57 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  27.08 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  25.91 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  27.65 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  28.66 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  28.63 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  28.95 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  34.68 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  31.25 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  26.41 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.65 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  30.09 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  27.88 
 
 
365 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  37.5 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  28.62 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 
351 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  26.58 
 
 
383 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30.56 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  29.3 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  31.5 
 
 
342 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  28.36 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  28.36 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.34 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.34 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  45.9 
 
 
129 aa  50.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.34 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  27.75 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  31.43 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  24.66 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25.53 
 
 
355 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.74 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.34 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  36.47 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.62 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  26.95 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  37.68 
 
 
302 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>