87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2694 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 360 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  34.75 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  32.96 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  30.61 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  31.18 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 372 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  33.55 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  30.28 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.36 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  28.61 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.32 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  30.38 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  31.87 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  30.93 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.12 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.19 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  29.94 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  33.22 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  28.98 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.41 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  30.59 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.19 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  27.24 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  27.38 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  29.15 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.31 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  29.65 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  28.84 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  34.48 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  26.35 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  28.48 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  31.08 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  30.56 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  30.56 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  25.8 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  31.03 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  31.03 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  31.03 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.69 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  31.84 
 
 		 416 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  22.55 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  25.54 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  25.77 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  26.81 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  26.71 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  30.52 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  28.33 
 
 		 255 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  52.94 
 
 		 95 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  22.22 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  34.83 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  27.43 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  23.97 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  34.21 
 
 		 175 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  40.91 
 
 		 129 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  28.85 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  26.82 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2970  hypothetical protein  29.73 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284014  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  25.47 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  26.26 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  28.36 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  31.31 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  38.81 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  38.81 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  27.27 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  42.37 
 
 		 147 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  28.82 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 512 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 243 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  28.85 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  32.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  29.1 
 
 		 156 aa  43.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  32.38 
 
 		 196 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  40 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  30.3 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  29.09 
 
 		 289 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>