131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0678 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  37.42 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  35.93 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  36.94 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  38.1 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.72 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  38.18 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  35.42 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  38.84 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  35.97 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  32.35 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  33.1 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  35.2 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  33.12 
 
 		 349 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  33.77 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  29.68 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  41.94 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  39.56 
 
 		 390 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  32.79 
 
 		 352 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  32.45 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  32.28 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  45.07 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  26.88 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4638  protein of unknown function DUF955  34.44 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 366 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  37.74 
 
 		 295 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  31.3 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  33.98 
 
 		 376 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  42.25 
 
 		 435 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  30.07 
 
 		 419 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  42.25 
 
 		 435 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  28.95 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  31.21 
 
 		 272 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  33.06 
 
 		 359 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 347 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.35 
 
 		 270 aa  51.2  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.32 
 
 		 355 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  30.14 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  30.99 
 
 		 295 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 346 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  34.04 
 
 		 415 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  34.62 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  30.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.66 
 
 		 362 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  34.97 
 
 		 383 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 352 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  31.61 
 
 		 454 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  35.58 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  31.08 
 
 		 1177 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.37 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  26.97 
 
 		 386 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  35.11 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  27.21 
 
 		 383 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  27.66 
 
 		 383 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  31.9 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.82 
 
 		 1180 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  32.39 
 
 		 269 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  29.59 
 
 		 400 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0468  helix-turn-helix domain protein  34.02 
 
 		 426 aa  48.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  27.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  30.26 
 
 		 354 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  33.88 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  29.86 
 
 		 383 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  30.4 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  30.5 
 
 		 385 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  41.54 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.69 
 
 		 355 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  30.4 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  32.76 
 
 		 342 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  27.63 
 
 		 384 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  26.61 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  30.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  29.86 
 
 		 372 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  28.23 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  28.23 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  28.39 
 
 		 357 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  28.83 
 
 		 350 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  29.6 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  29.93 
 
 		 395 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  35.04 
 
 		 294 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  31.39 
 
 		 391 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  31.39 
 
 		 391 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 367 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  27.56 
 
 		 367 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  33.1 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  33.1 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  33.1 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  29.91 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  35 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 367 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  33.96 
 
 		 370 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>