58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2613 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  99.54 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  97.69 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1262  hypothetical protein  38.59 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.228551  normal  0.373581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  33.77 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  29.86 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  29.09 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1654  hypothetical protein  27.05 
 
 		 639 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  27.95 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  27.83 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  32.24 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2822  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  29.53 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  35.24 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  35.24 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  32.76 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  52.54 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  27.59 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  45.45 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 1180 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2864  hypothetical protein  24.21 
 
 		 622 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000347302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  38.24 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  37.08 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  31.03 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  38.81 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0371  hypothetical protein  24.21 
 
 		 612 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0894657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.4 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  26.77 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  36 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  31.2 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  29.85 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  31.01 
 
 		 173 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  27.23 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  44.44 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  26.61 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  44.07 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  26.61 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  26.61 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  33.88 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  36.52 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  44.07 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  36.67 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  41.43 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  29.13 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  45.9 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  40.24 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  41.18 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  42.37 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  30.33 
 
 		 170 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  26.34 
 
 		 386 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  40.32 
 
 		 395 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 1177 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  27.81 
 
 		 435 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  27.81 
 
 		 435 aa  41.6  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>