30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0537 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  843    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  48.9 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  31.45 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  28.04 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  27.92 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  27.9 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  30.9 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  28.82 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  28.84 
 
 		 383 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  29.01 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  28.93 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  30.97 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  25.49 
 
 		 415 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  27.37 
 
 		 378 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  31.58 
 
 		 284 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  29.71 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  24.94 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  26.5 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  24.21 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.85 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.1 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  24.35 
 
 		 257 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  23.46 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  26.42 
 
 		 354 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  21.71 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  29.31 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  29.31 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>