36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1505 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  86.72 
 
 		 384 aa  659    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  85.38 
 
 		 383 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  784    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  43.52 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  40.74 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  51.12 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  39.74 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  36.36 
 
 		 376 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  28.87 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  26.67 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  24.94 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  29.6 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  29.01 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1822  hypothetical protein  40.83 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0401473  normal  0.904064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  28.32 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  26.3 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  26.89 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.99 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  27.32 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  25.54 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  27.06 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  27.17 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  27.17 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  27.21 
 
 		 156 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  30.07 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.07 
 
 		 174 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  28.79 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  25.42 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  26.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  31.45 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  32.08 
 
 		 221 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>