25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5883 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 397 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  48.9 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  25.56 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  26.53 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  26.13 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  36.06 
 
 		 377 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  31.66 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  32.12 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  32.5 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  29.6 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  31.56 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  28.45 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  29.89 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  28.34 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  30.19 
 
 		 284 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  27.73 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  27.04 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.19 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  26.02 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  23.6 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  24.46 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.47 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.47 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>