40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0309 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  795    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  56.85 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  29.15 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  31.65 
 
 
381 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  30.22 
 
 
378 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  28.04 
 
 
419 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  28.05 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  28.65 
 
 
383 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  28.15 
 
 
384 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  28.91 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  26.85 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  26.3 
 
 
383 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  26.67 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  29.53 
 
 
376 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  25.88 
 
 
397 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  26.64 
 
 
284 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  23.75 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1822  hypothetical protein  27.91 
 
 
242 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0401473  normal  0.904064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  22.5 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  22.94 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  23.1 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  24.36 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  24.63 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  22.76 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  24.08 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  24.69 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  27.74 
 
 
255 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  27.74 
 
 
255 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  20.07 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  23.87 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  33.62 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  27.47 
 
 
174 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  30.82 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  29.91 
 
 
156 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  23.41 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  20.91 
 
 
350 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  31.2 
 
 
255 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>