16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2309 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  490  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2929  protein of unknown function DUF955  49.37 
 
 
235 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0395  hypothetical protein  34.52 
 
 
289 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  33.03 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  33.67 
 
 
147 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  28.32 
 
 
454 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  29.84 
 
 
177 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  23.42 
 
 
270 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 
397 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  24.24 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  26.32 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  24.55 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  29.9 
 
 
378 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.79 
 
 
160 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  26.72 
 
 
254 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  29.81 
 
 
383 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>