59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3885 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  760    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  31.41 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  31.73 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  31.61 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  30.7 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  28.45 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  29.62 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.01 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  28.32 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  29.77 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  24.94 
 
 		 419 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  23.33 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  26.73 
 
 		 383 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  28.09 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  31.66 
 
 		 284 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  23.75 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  28.21 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  25.57 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  20.51 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  24.5 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  24.5 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  23.51 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.38 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  25.73 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  23.02 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  24.75 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  25.09 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  25.17 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  33.59 
 
 		 182 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  25.84 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  32.62 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  27.35 
 
 		 257 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  25.94 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  24.76 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  23.88 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  24.8 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  27.59 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  27.74 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.31 
 
 		 188 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  22.94 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  21.87 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  33.06 
 
 		 221 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.58 
 
 		 255 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.85 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  25.77 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  23.23 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  26.67 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  28.4 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  29 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.27 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  28.95 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  28.24 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>