123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6153 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 359 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  60.73 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  48.62 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  33.52 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  32.96 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  35.57 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  29.88 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  30.57 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  32.89 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  30.83 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  32.67 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.72 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  30.47 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  27.96 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  25.91 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  31.76 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  27.44 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  27.6 
 
 		 400 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  25.91 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  25.91 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  28.05 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  30.27 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  33.11 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  30.98 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.89 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.89 
 
 		 367 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  27.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.59 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  27.76 
 
 		 401 aa  93.6  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.58 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.1 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  28.71 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  32.37 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  32.47 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  28.31 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  25.68 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.75 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  23.67 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  23.72 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  30.69 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  26.41 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  26.41 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  26.41 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  27.23 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  22.74 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  21.25 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  23.62 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  28.39 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  36.99 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  29.94 
 
 		 174 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  34.65 
 
 		 175 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.78 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.06 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  24.07 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  30.07 
 
 		 188 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  35.9 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  23.44 
 
 		 273 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  25.48 
 
 		 383 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  32.18 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  36.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.6 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  31.76 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  44.07 
 
 		 129 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  27.89 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  31.63 
 
 		 266 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  31.73 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  23.18 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.23 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  34.17 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  25 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  28.41 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  27.78 
 
 		 170 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  28.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  38.81 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>