32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  100 
 
 		 387 aa  768    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  45.92 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  47.53 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  39.74 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  39.12 
 
 		 383 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  38.64 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  38.34 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  39.33 
 
 		 284 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  33.7 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1822  hypothetical protein  47.7 
 
 		 242 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0401473  normal  0.904064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  28.91 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  31.15 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  28.95 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  24.92 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  30.97 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  31.56 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  27.32 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  29.77 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.05 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  26.61 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.81 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  27.5 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  25.49 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  24.4 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.79 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  23.27 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  32.38 
 
 		 188 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  26.87 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  24.41 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  23.53 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>