97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4600 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 350 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  43.18 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  40.41 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  41.31 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  40.65 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  40.77 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  38.12 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  38.82 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  37.85 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  30.33 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  32.67 
 
 		 400 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  33.92 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.17 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  32.14 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  29.68 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  32.51 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  28.9 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  29.77 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  28.9 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.13 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  30.59 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  30.48 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  31.77 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.07 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.64 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  26.06 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  30.93 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  26.77 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  26.77 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.91 
 
 		 401 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  32.33 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.06 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.33 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  30.86 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  25.76 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  21.19 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  24.92 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  27.21 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  25 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.78 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  25.35 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  28.16 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  37.5 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  37.5 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  24.91 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  37.5 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  24.82 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  25.54 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  28.73 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  28.73 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  36.84 
 
 		 173 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.65 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  25.84 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  23.05 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  25.58 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.19 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  28.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  27.17 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  36.63 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  37.23 
 
 		 169 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  32.46 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  24.67 
 
 		 385 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  38.89 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  26.32 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  19.64 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  29.79 
 
 		 175 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  25.49 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  29.46 
 
 		 147 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  34.71 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  24.12 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.22 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  24.62 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.83 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.87 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  35.05 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  27.35 
 
 		 177 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.86 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  28.91 
 
 		 165 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  20.91 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  27.64 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>