50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0389 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  42.98 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  24.74 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  40.19 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.06 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.98 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.2 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  26.76 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  34.95 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  33.85 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.57 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  25.27 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  27.61 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  25.42 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  28.95 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  28.95 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  36.54 
 
 		 174 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  28.44 
 
 		 474 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2393  helix-turn-helix domain protein  45.71 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  24.07 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  29.63 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4971  helix-turn-helix domain protein  37.65 
 
 		 111 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  30.07 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  28.03 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  36.19 
 
 		 175 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  34.56 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  25.55 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  38.46 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1825  hypothetical protein  28.15 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  27.62 
 
 		 171 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  25.13 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  31.58 
 
 		 270 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  25.53 
 
 		 170 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 321 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  26.19 
 
 		 377 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.3 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  20.77 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  23.81 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>