66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0443 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  5e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  38.61 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  37.82 
 
 		 160 aa  94  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  37.42 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.75 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.67 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  37.59 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  30.91 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  35.12 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.81 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  34.44 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  27.18 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  30.72 
 
 		 1177 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  26.67 
 
 		 435 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  26.9 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.17 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  31.76 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33.94 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  28.93 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  28.93 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  28.93 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  29.81 
 
 		 261 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  50.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  32.19 
 
 		 295 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  35.96 
 
 		 302 aa  50.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  33.33 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  31.09 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  28.78 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  34.88 
 
 		 107 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  25.55 
 
 		 370 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  28.79 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  28.97 
 
 		 383 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  30.3 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  28.47 
 
 		 257 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  25.15 
 
 		 357 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  29.52 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  28.46 
 
 		 236 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.51 
 
 		 251 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.78 
 
 		 359 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 1180 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  25.16 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  25.53 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  26.75 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  28.18 
 
 		 347 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  31.4 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  27.14 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2864  hypothetical protein  31.3 
 
 		 622 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000347302  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B25  hypothetical protein  27.36 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.548873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0371  hypothetical protein  31.3 
 
 		 612 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0894657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  26.58 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  30.33 
 
 		 216 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  31.53 
 
 		 307 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  25.79 
 
 		 292 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  23.15 
 
 		 381 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  31.4 
 
 		 296 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  30.21 
 
 		 271 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  30.21 
 
 		 271 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3017  hypothetical protein  27.04 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  30.33 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  26.45 
 
 		 291 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  24.28 
 
 		 390 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  27.62 
 
 		 267 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  28.15 
 
 		 352 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>