21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0509 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  223  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  56.57 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  40.26 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  34.88 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  35.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  35.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  43.75 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  36.76 
 
 		 435 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  36.76 
 
 		 435 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  36.84 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  43.94 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  51.16 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  31.07 
 
 		 505 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  42.31 
 
 		 382 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  32.22 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  47.83 
 
 		 382 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 283 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  24.39 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>