144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0882 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  52.6 
 
 		 175 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  44.38 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  42.31 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  36.42 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  40.8 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  36.94 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  32.74 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  34.65 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.83 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  35.33 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  32.05 
 
 		 370 aa  64.3  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  31.58 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33.85 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  34.44 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.94 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  34.46 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  36.3 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  32.1 
 
 		 246 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  31.43 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  38.81 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  27.95 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  27.95 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  28.18 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  27.95 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  31.21 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  30.56 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  30.56 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  27.62 
 
 		 435 aa  57.8  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  33.85 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  32.31 
 
 		 1180 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  36.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  29.23 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  34.59 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  29.31 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  32.68 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  31.25 
 
 		 362 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  32.17 
 
 		 357 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  33.59 
 
 		 375 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  29.8 
 
 		 295 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 1177 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  33.05 
 
 		 394 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.95 
 
 		 352 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 367 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  29.55 
 
 		 302 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  32.28 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  28.69 
 
 		 367 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  33.09 
 
 		 286 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  36.27 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  28.69 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  35.54 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  29.46 
 
 		 359 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  37.82 
 
 		 366 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.15 
 
 		 395 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.94 
 
 		 366 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  40.58 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  25.84 
 
 		 382 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  30.23 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 422 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  29.53 
 
 		 296 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  28.15 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  28.15 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  34.83 
 
 		 360 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  31.53 
 
 		 295 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  31.93 
 
 		 257 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  28.68 
 
 		 284 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  30.15 
 
 		 257 aa  48.5  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  30.43 
 
 		 269 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  30.28 
 
 		 220 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  30.58 
 
 		 382 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  38.96 
 
 		 142 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  30.66 
 
 		 319 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 396 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  30.15 
 
 		 383 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.1 
 
 		 399 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.16 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.64 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  27.87 
 
 		 400 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  29.46 
 
 		 410 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  44.62 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  28.1 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.68 
 
 		 354 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1607  hypothetical protein  26.47 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184487  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  29.17 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  25.56 
 
 		 372 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  27.88 
 
 		 372 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  30.82 
 
 		 267 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>