67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0050 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 160 aa  332  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  39.24 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  37.82 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  36.24 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  34.76 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  30.6 
 
 		 410 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  34.15 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  34.96 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  34.55 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  37.27 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  28.95 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  29.5 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.45 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  34.56 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  30.38 
 
 		 271 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  30.38 
 
 		 271 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.07 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  28.44 
 
 		 355 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  30.97 
 
 		 302 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B25  hypothetical protein  22.07 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.548873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  28.05 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01690  predicted Zn peptidase  29.5 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  34.58 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  27.61 
 
 		 352 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.02 
 
 		 283 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  30.23 
 
 		 381 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 359 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  27.86 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  28.47 
 
 		 292 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  31.03 
 
 		 370 aa  45.1  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  23.78 
 
 		 294 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  29.13 
 
 		 341 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  38.24 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2929  protein of unknown function DUF955  26.32 
 
 		 235 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  44.3  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  28.32 
 
 		 362 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  33.88 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  28.06 
 
 		 289 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  33.71 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  28.47 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  29.5 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  33.06 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  33.06 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  30.11 
 
 		 257 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  35.37 
 
 		 302 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  32.84 
 
 		 415 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  29.67 
 
 		 295 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  32.43 
 
 		 291 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  34.72 
 
 		 378 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  29.67 
 
 		 295 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  29.67 
 
 		 295 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  37.35 
 
 		 285 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  26.14 
 
 		 251 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  28.18 
 
 		 295 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 410 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  31 
 
 		 227 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  29.6 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  23.87 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.84 
 
 		 355 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>