41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4791 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  39.43 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  33.73 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  30.86 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  30.86 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  33.77 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  26.29 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  31.01 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  28.89 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  28.12 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  26.22 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  25.49 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  38.32 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.31 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  24.59 
 
 		 292 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  33.04 
 
 		 302 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  28.21 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  23.57 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  29.34 
 
 		 175 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.46 
 
 		 359 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  23.36 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  23.36 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  23.36 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  29.41 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  31.13 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  26.17 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  31.91 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  23.92 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  26.88 
 
 		 174 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  27.1 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  26.21 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  25.85 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  28.32 
 
 		 173 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.47 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  30.11 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  30.11 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  26.72 
 
 		 241 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>