18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1743 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  490  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1654  hypothetical protein  34.33 
 
 		 639 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0371  hypothetical protein  30.6 
 
 		 612 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0894657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2864  hypothetical protein  30.6 
 
 		 622 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000347302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  31.85 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  29.38 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1262  hypothetical protein  28.8 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.228551  normal  0.373581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  30.15 
 
 		 425 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0956  hypothetical protein  34.38 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000575682  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2822  hypothetical protein  26.89 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  26.75 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  25.98 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  28.91 
 
 		 182 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  25.13 
 
 		 261 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>