16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1746 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  31.85 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1654  hypothetical protein  28.39 
 
 		 639 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0371  hypothetical protein  27.16 
 
 		 612 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0894657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2864  hypothetical protein  27.16 
 
 		 622 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000347302  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  29.41 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  29.02 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  29.02 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1262  hypothetical protein  31.28 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.228551  normal  0.373581 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2822  hypothetical protein  32.21 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0408  protein of unknown function DUF955  25.68 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  27.59 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  29.27 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  35.11 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  26.95 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  24.14 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>