40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2296 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  82.45 
 
 		 302 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  38.85 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  36.86 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  38.46 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  37.23 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  33.1 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.56 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  30.8 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  30.8 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  30.8 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  34.55 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  32.23 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  26.22 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  27.46 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  25.77 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  27.38 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  35.19 
 
 		 173 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  27.57 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  26.09 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  29.6 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.45 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  28.24 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  33.67 
 
 		 394 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  30.61 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  30.61 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  35.11 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  27.36 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  28.44 
 
 		 188 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  28.24 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  28.83 
 
 		 168 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  30.39 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  41.18 
 
 		 216 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  27.27 
 
 		 147 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  26.09 
 
 		 400 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  26.09 
 
 		 404 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  29.52 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>