55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5156 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  48.4 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  37.73 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  34.01 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  36.99 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  37.23 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  36.11 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  32.67 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  32.67 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  32.67 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33.96 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  26.81 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  27.75 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  30.22 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  27.87 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  26.82 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  37.08 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  29.13 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  39.13 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  39.13 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  26.34 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  35.92 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  32.26 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  24.59 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  32.76 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  24.63 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  27.63 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  24.46 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30.68 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  36.67 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  32.69 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  31.9 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  35.16 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30.63 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  34.94 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.92 
 
 		 173 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.47 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.41 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  32.58 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.52 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  35.79 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  40.62 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  29.27 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  36.92 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  35.56 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  40.62 
 
 		 168 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  31.11 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  45.61 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.69 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  45.61 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  27.2 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  40.24 
 
 		 216 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  27.81 
 
 		 221 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>