58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2718 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  49.62 
 
 		 269 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  33.52 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  31.55 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  34.16 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  34.46 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  26.78 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  26.78 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  33.11 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  35.16 
 
 		 142 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  29.13 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  30.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  30.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.86 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  30.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  27.03 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  28.93 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  28.79 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  28.7 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.46 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  24.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  26.67 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  25.69 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  28.12 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  32.61 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  37.08 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  28.16 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  31.63 
 
 		 359 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  38.89 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  39.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  25.82 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  31.67 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  39.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.83 
 
 		 355 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  32.67 
 
 		 365 aa  45.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  30.4 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  26.11 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  39.39 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  32 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  26.67 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  29.29 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  28 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  41.1 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28 
 
 		 395 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  24.19 
 
 		 360 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  33.04 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  35.23 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 422 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.18 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  34.57 
 
 		 370 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>