80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0188 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  42.59 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  31.83 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.53 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  30.98 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.1 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  29.77 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  32.32 
 
 		 357 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  33.57 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.92 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.06 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  31.27 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.89 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  29.93 
 
 		 354 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  26.65 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  25.91 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  30.25 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.67 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  28.49 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.23 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  29.51 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  31.77 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  27.08 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  25.85 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  26.89 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  26.89 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  26.35 
 
 		 360 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.96 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  25.86 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.63 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  24.12 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  25.58 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  26.32 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  24.41 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  26.77 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  26.17 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  22.22 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  24.51 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  24.54 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  26.58 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  26.58 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  26.58 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  22.63 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  32.26 
 
 		 292 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.03 
 
 		 174 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  37.63 
 
 		 169 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  34.97 
 
 		 156 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  37.37 
 
 		 173 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  25.38 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  24.41 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  25.42 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  41.38 
 
 		 182 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  33.12 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  32.61 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  29.41 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  29.17 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  32.11 
 
 		 251 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  31.73 
 
 		 269 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  30.17 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.15 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 259 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  26.02 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  26.58 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  24.72 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  28.87 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  24.72 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  27.2 
 
 		 215 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>